灭菌是用理化方法杀死一定物质中的微生物的微生物学基本技术。灭菌的彻底程度受灭菌时间与灭菌剂强度的制约。微生物对灭菌剂的抵抗力取决于原始存在的群体密度、菌种或环境赋予菌种的抵抗力。灭菌是获得纯培养的必要条件，也是食品工业和医药领域中必需的技术。灭菌常用的方法有化学试剂灭菌、射线灭菌、干热灭菌、湿热灭菌和过滤除菌等。可根据不同的需求，采用不同的方法，如培养基灭菌一般采用湿热灭菌，空气则采用过滤除菌。
    对应地，灭菌指示产品是用来验证灭菌是否完成或完全的,通常分为化学灭菌指示剂和生物灭菌指示剂。化学灭菌指示剂一般只能用来做过程判断，即灭菌是否进行过，或是否达到过灭菌条件。而生物灭菌指示剂则可以通过极限法来验证灭菌是否完全。所谓极限法，即用对灭菌过程耐受最强的几种菌株芽孢，放在灭菌环境中的“冷点”，再启动灭菌过程。在灭菌之后，将芽孢培养，如果仍有活性，则判为灭菌失败。反之则合格。通常用来验证灭菌的菌株为枯草芽孢杆菌（验证干热灭菌）、嗜热芽孢杆菌（验证高温高压灭菌，EO灭菌）、短小芽孢杆菌（验证辐射灭菌）。